Skyline 软件

Skyline 软件

仅限研究使用,不可用于诊断程序。

Skyline 软件是一个 Windows 客户端应用程序,用于建立多反应监测 (MRM) 和全扫描(MS1 和 MS/MS)定量方法及分析得到的质谱数据。它采用尖端技术创建和反复优化靶向方法,从而进行大规模蛋白质组学研究。

从华盛顿大学的 MacCoss 实验室免费下载 Skyline 软件

概述

Skyline 是一个建立和优化多反应监测 (MRM) 分析方法的综合软件包。可以从以前的结果将蛋白质和多肽数据加载至 Skyline,或从 Microsoft Excel 或图谱库数据粘贴。然后,使用预测性算法,为采集方法选择多肽最优化的电荷数状态和碎片离子。用户拥有多肽设置和离子对设置的完全控制权,可以指定每个方法的离子对数、预设时间 MRM™ 试验方法、设置参数优化,或者浏览一个带有所有色谱设置的模板方法。

在采集数据的同时,一组丰富的谱图显示结果,并提供强大的工具检查数据完整性,帮助仪器操作员提早发现问题。如果有足够的屏幕分辨率,Skyline 可以同时在 10 个以上的图形窗格中显示有用信息,并且可以随着选择的变化而更新,感觉不到任何延迟。

图 1:探索使用 QTRAP 系统生成的 MRM™ 数据。多肽和离子对信息显示在左侧。在导航窗格中单击多肽和离子对可以显示相关的 MRM 离子对和 MS/MS 数据。多肽和离子对旁边的小点表示信号强度。绿色表示离子信号强、黄色表示稍弱。没有小点表示没有采集到相应的多肽离子对的数据。

 

Exploring QTRAP System MRM Data

 

 

图 2:探索使用 TripleTOF™ 系统生成的高分辨率 MRM (MRMHR) 数据。可以生成和显示每个多肽的母离子和碎片离子的高分辨率提取离子色谱 (XIC)。在这种情况下,每个多肽和碎片离子的色谱保留时间和强度都会与相同多肽的其他碎片离子信号强度一起显示,从而更好地确定优化的碎片和潜在有问题的碎片。

Exploring TripleTOF System MRM Data