Data Explorer软件中有什么设置可以让我获得更好的质谱图?
| 日期: | 07/09/2018 |
| 类别: |
仅用于科研，不用于诊断
回答
1) Baseline 和Advanced Baseline Correction 
Advance baseline orrection 在线形噪音(高质量端)的质谱图更有帮助。如蛋白或DNA样品。
2) 降噪的类型
- Noise Removal (真正的降噪)
- Noise Filtering (真正的降噪)
- Default Smoothing (基于分辨率)
- Gaussian Smoothing (经典平滑)
3) Noise Removal NR(2.00)
程序设定质谱图的噪音为白噪声。在噪声区域范围内，程序会随即减少其波动。可以用程序中的“Std Dev to remove”数值设定噪声范围。通常这个值设为2，指信噪比低于2（RMS）的所有信号将被去除。这个设定非常降噪，而如果设定为1，效果则没有那么明显。这项技术不像经典的平滑，不会较少峰的分辨率。
- 降噪效果非常好
- 通常参数值比较少，由2改为1可避免钉子峰
- 基本能保持原峰的分辨率
- 能达到很好的展示目的
4) Noise Filtering NF(0.7)
未被过滤得噪声是随机及没有相关性的，而信号是有非常相关的，Y值会连续变化，由峰高逐渐较少。噪声过滤器设计为能识别数据的相关性，以过滤没有相关性的噪声。相关性是唯一的参数，它能决定多少噪声会被过滤掉。其值设定范围是0至1，默认为0.7。分辨率的损失非常少。
- 参数少，通常默认0.7会获得最好的数据
- 降噪时能保持分辨率
- 不影响基线附件的小峰
5) Default smoothing (基于分辨率的 gaussian)
这是经典高斯平滑的高级功能。过滤的改变取决于质量范围内峰在采集时设置的分辨率。经典的平滑在低分子与高分子之间。程序参数较少， 依赖于峰检测器设置。
- 最好在高质量端，每个峰数据点很多的的数据上使用
- 依赖于合适的峰检测参数
- 注意：不要用于高分辨数据 – 例如有很好的同位素簇的多肽
6) Smoothing
经典的平滑程序可以修改平滑点数（3至353），可以通过选中采集的信号（蓝底），“suggested”建议出一个值使得程序更容易使用。
- 程序的量已知
- 可以让用户输入大范围的数值
- 数据输出后可与其他数据输出比较
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